MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis D182038 plasmid pCD1

Total Repeats: 1402

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017157	CTGG	2	8	109	116	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017157	GTTC	2	8	148	155	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017157	CTG	2	6	198	203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017157	CT	3	6	231	236	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017157	ACA	2	6	281	286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017157	GCT	2	6	458	463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124321
7	NC_017157	CGG	2	6	469	474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384124321
8	NC_017157	GAC	2	6	555	560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124321
9	NC_017157	CGA	2	6	661	666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124321
10	NC_017157	CG	3	6	699	704	0 %	0 %	50 %	50 %	384124321
11	NC_017157	GTCA	2	8	840	847	25 %	25 %	25 %	25 %	384124321
12	NC_017157	GCC	2	6	892	897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384124321
13	NC_017157	GCG	2	6	936	941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384124321
14	NC_017157	TAA	2	6	1029	1034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017157	CAA	2	6	1037	1042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017157	GTG	3	9	1069	1077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124322
17	NC_017157	TGA	2	6	1085	1090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124322
18	NC_017157	TA	3	6	1135	1140	50 %	50 %	0 %	0 %	384124322
19	NC_017157	TTA	2	6	1146	1151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384124322
20	NC_017157	C	6	6	1193	1198	0 %	0 %	0 %	100 %	384124322
21	NC_017157	AT	3	6	1228	1233	50 %	50 %	0 %	0 %	384124322
22	NC_017157	AT	3	6	1243	1248	50 %	50 %	0 %	0 %	384124322
23	NC_017157	TAAG	2	8	1255	1262	50 %	25 %	25 %	0 %	384124322
24	NC_017157	TCA	2	6	1272	1277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124322
25	NC_017157	GTT	2	6	1405	1410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124322
26	NC_017157	AAT	2	6	1413	1418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384124322
27	NC_017157	ATA	2	6	1457	1462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017157	TTTTG	2	10	1532	1541	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017157	AAC	2	6	1550	1555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017157	CAG	2	6	1561	1566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017157	T	6	6	1570	1575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017157	TAA	2	6	1629	1634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017157	ATC	2	6	1649	1654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017157	ATTT	2	8	1655	1662	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017157	AGC	2	6	1701	1706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017157	AGCC	2	8	1805	1812	25 %	0 %	25 %	50 %	384124323
37	NC_017157	ATC	2	6	1829	1834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124323
38	NC_017157	GGT	2	6	1895	1900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124323
39	NC_017157	TGC	2	6	1967	1972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124323
40	NC_017157	GCA	2	6	1994	1999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124323
41	NC_017157	TGC	2	6	2023	2028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124323
42	NC_017157	TGG	2	6	2111	2116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124323
43	NC_017157	TGG	2	6	2192	2197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124323
44	NC_017157	GGC	2	6	2198	2203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384124323
45	NC_017157	GCAG	2	8	2237	2244	25 %	0 %	50 %	25 %	384124323
46	NC_017157	T	6	6	2388	2393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017157	TC	3	6	2424	2429	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017157	TAC	2	6	2438	2443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124324
49	NC_017157	ATCTAT	2	12	2467	2478	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384124324
50	NC_017157	GCA	2	6	2487	2492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124324
51	NC_017157	TA	3	6	2524	2529	50 %	50 %	0 %	0 %	384124324
52	NC_017157	TA	3	6	2531	2536	50 %	50 %	0 %	0 %	384124324
53	NC_017157	TCA	2	6	2711	2716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124324
54	NC_017157	GCA	2	6	2754	2759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017157	A	6	6	2761	2766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017157	AT	3	6	2887	2892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017157	AGCC	2	8	3031	3038	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017157	AT	3	6	3051	3056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017157	TGC	2	6	3092	3097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017157	CGC	2	6	3098	3103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_017157	CAG	2	6	3119	3124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017157	CAC	2	6	3256	3261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_017157	GT	3	6	3282	3287	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017157	TCA	2	6	3315	3320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017157	AC	3	6	3368	3373	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017157	A	7	7	3408	3414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017157	T	6	6	3415	3420	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017157	A	8	8	3449	3456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017157	GGAT	2	8	3544	3551	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017157	CAT	2	6	3571	3576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017157	AGAT	2	8	3606	3613	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017157	TGA	2	6	3619	3624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017157	CCG	2	6	3629	3634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_017157	GTT	2	6	3662	3667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017157	ATT	2	6	3747	3752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017157	A	7	7	3802	3808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017157	AAG	2	6	4139	4144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017157	TCT	2	6	4149	4154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017157	TAAA	2	8	4187	4194	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017157	TTC	2	6	4272	4277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124325
81	NC_017157	AGAA	2	8	4316	4323	75 %	0 %	25 %	0 %	384124325
82	NC_017157	T	7	7	4367	4373	0 %	100 %	0 %	0 %	384124325
83	NC_017157	TC	3	6	4395	4400	0 %	50 %	0 %	50 %	384124325
84	NC_017157	TTC	2	6	4422	4427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124325
85	NC_017157	GTA	2	6	4429	4434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124325
86	NC_017157	ATT	2	6	4497	4502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384124325
87	NC_017157	CAGCC	2	10	4584	4593	20 %	0 %	20 %	60 %	384124325
88	NC_017157	AAT	2	6	4611	4616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384124325
89	NC_017157	GA	4	8	4622	4629	50 %	0 %	50 %	0 %	384124325
90	NC_017157	TCG	2	6	4715	4720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124325
91	NC_017157	TCA	2	6	4762	4767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124325
92	NC_017157	ACCA	2	8	4776	4783	50 %	0 %	0 %	50 %	384124325
93	NC_017157	CTG	2	6	4884	4889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124325
94	NC_017157	ACG	2	6	4925	4930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124325
95	NC_017157	TAA	2	6	4938	4943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384124325
96	NC_017157	TGC	2	6	4998	5003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124325
97	NC_017157	TTCC	2	8	5029	5036	0 %	50 %	0 %	50 %	384124325
98	NC_017157	AAGC	2	8	5084	5091	50 %	0 %	25 %	25 %	384124325
99	NC_017157	CCG	2	6	5099	5104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384124325
100	NC_017157	CAT	2	6	5147	5152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124325
101	NC_017157	AATT	2	8	5156	5163	50 %	50 %	0 %	0 %	384124325
102	NC_017157	TCA	2	6	5195	5200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124325
103	NC_017157	AGC	2	6	5282	5287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124326
104	NC_017157	GTCA	2	8	5357	5364	25 %	25 %	25 %	25 %	384124326
105	NC_017157	AAC	2	6	5369	5374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384124326
106	NC_017157	TCCA	2	8	5418	5425	25 %	25 %	0 %	50 %	384124326
107	NC_017157	GACT	2	8	5430	5437	25 %	25 %	25 %	25 %	384124326
108	NC_017157	CCG	2	6	5566	5571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384124326
109	NC_017157	CAG	2	6	5593	5598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124326
110	NC_017157	CAT	2	6	5656	5661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124326
111	NC_017157	GACT	2	8	5672	5679	25 %	25 %	25 %	25 %	384124326
112	NC_017157	AGC	2	6	5684	5689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124326
113	NC_017157	TAA	2	6	5693	5698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384124326
114	NC_017157	AAG	2	6	5776	5781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384124326
115	NC_017157	AGC	2	6	5825	5830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124326
116	NC_017157	ATC	2	6	5831	5836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124326
117	NC_017157	ATA	2	6	5849	5854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384124326
118	NC_017157	CAA	2	6	5858	5863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384124326
119	NC_017157	TCT	2	6	5868	5873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124326
120	NC_017157	ATCA	2	8	5939	5946	50 %	25 %	0 %	25 %	384124326
121	NC_017157	CCAT	2	8	5971	5978	25 %	25 %	0 %	50 %	384124326
122	NC_017157	GATGTC	2	12	5994	6005	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384124326
123	NC_017157	CAC	2	6	6013	6018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384124326
124	NC_017157	AAC	2	6	6041	6046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384124326
125	NC_017157	TTTGG	2	10	6060	6069	0 %	60 %	40 %	0 %	384124326
126	NC_017157	TGGA	2	8	6111	6118	25 %	25 %	50 %	0 %	384124326
127	NC_017157	CAG	2	6	6226	6231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124326
128	NC_017157	AGC	2	6	6266	6271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124326
129	NC_017157	TAT	2	6	6368	6373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384124326
130	NC_017157	A	6	6	6408	6413	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017157	AAC	2	6	6421	6426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017157	AT	3	6	6442	6447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017157	CGC	2	6	6466	6471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_017157	GAC	2	6	6548	6553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017157	CTG	2	6	6589	6594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017157	CTTT	2	8	6603	6610	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_017157	TCG	2	6	6615	6620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017157	CAG	2	6	6625	6630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017157	AT	3	6	6640	6645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017157	A	6	6	6700	6705	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017157	TCAG	2	8	6715	6722	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017157	CAC	2	6	6812	6817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_017157	CGC	2	6	6930	6935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_017157	CAT	2	6	6957	6962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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147	NC_017157	TGTAG	2	10	7102	7111	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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150	NC_017157	TGT	2	6	7202	7207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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273	NC_017157	TCC	2	6	13625	13630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384124335
274	NC_017157	TA	4	8	13645	13652	50 %	50 %	0 %	0 %	384124335
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276	NC_017157	A	6	6	13720	13725	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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412	NC_017157	TTG	2	6	19679	19684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124340
413	NC_017157	CTT	2	6	19711	19716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124340
414	NC_017157	AAT	2	6	19727	19732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384124340
415	NC_017157	TTA	2	6	19779	19784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384124340
416	NC_017157	TGT	2	6	19785	19790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124340
417	NC_017157	GCTT	2	8	19797	19804	0 %	50 %	25 %	25 %	384124340
418	NC_017157	TAT	2	6	19807	19812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384124340
419	NC_017157	CCG	2	6	20167	20172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384124340
420	NC_017157	CAT	2	6	20219	20224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124340
421	NC_017157	CCA	2	6	20254	20259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384124340
422	NC_017157	AGCC	2	8	20295	20302	25 %	0 %	25 %	50 %	384124340
423	NC_017157	GATGC	2	10	20313	20322	20 %	20 %	40 %	20 %	384124340
424	NC_017157	CTTG	2	8	20335	20342	0 %	50 %	25 %	25 %	384124340
425	NC_017157	TCT	2	6	20349	20354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124340
426	NC_017157	TTC	2	6	20388	20393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124340
427	NC_017157	CTT	2	6	20446	20451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124340
428	NC_017157	AAGC	2	8	20500	20507	50 %	0 %	25 %	25 %	384124340
429	NC_017157	GCCGC	2	10	20556	20565	0 %	0 %	40 %	60 %	384124340
430	NC_017157	AAT	2	6	20580	20585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384124340
431	NC_017157	CTT	2	6	20593	20598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124340
432	NC_017157	TGT	2	6	20601	20606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124340
433	NC_017157	TGGC	2	8	20619	20626	0 %	25 %	50 %	25 %	384124340
434	NC_017157	GTG	2	6	20638	20643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
435	NC_017157	TTG	2	6	20705	20710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
436	NC_017157	G	6	6	20719	20724	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
437	NC_017157	GAC	2	6	21047	21052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124341
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441	NC_017157	AGGA	2	8	21232	21239	50 %	0 %	50 %	0 %	384124341
442	NC_017157	GTC	2	6	21271	21276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124341
443	NC_017157	TTG	2	6	21279	21284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124341
444	NC_017157	TGAA	2	8	21352	21359	50 %	25 %	25 %	0 %	384124342
445	NC_017157	GTT	2	6	21415	21420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124342
446	NC_017157	T	6	6	21419	21424	0 %	100 %	0 %	0 %	384124342
447	NC_017157	GGT	2	6	21465	21470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124342
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450	NC_017157	T	7	7	21584	21590	0 %	100 %	0 %	0 %	384124342
451	NC_017157	TGG	2	6	21611	21616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124342
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454	NC_017157	CGG	2	6	21794	21799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384124342
455	NC_017157	TTC	2	6	21813	21818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124342
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457	NC_017157	CAA	2	6	21860	21865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384124342
458	NC_017157	ATC	3	9	21879	21887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124342
459	NC_017157	CGG	2	6	21896	21901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384124342
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462	NC_017157	ATC	2	6	22080	22085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124342
463	NC_017157	TTC	2	6	22179	22184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124342
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466	NC_017157	TGT	2	6	22249	22254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124342
467	NC_017157	AAT	2	6	22285	22290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
468	NC_017157	CAT	2	6	22300	22305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
469	NC_017157	TCA	2	6	22373	22378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
470	NC_017157	CGG	2	6	22410	22415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
471	NC_017157	CA	3	6	22467	22472	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
472	NC_017157	AAT	2	6	22481	22486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
473	NC_017157	TCA	2	6	22547	22552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
474	NC_017157	CCT	2	6	22576	22581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
475	NC_017157	TTATTT	2	12	22593	22604	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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480	NC_017157	GA	3	6	22749	22754	50 %	0 %	50 %	0 %	384124343
481	NC_017157	ATA	2	6	22788	22793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384124343
482	NC_017157	GTT	2	6	22868	22873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124343
483	NC_017157	CAT	2	6	23046	23051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124343
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490	NC_017157	ACT	2	6	23396	23401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124344
491	NC_017157	AT	3	6	23406	23411	50 %	50 %	0 %	0 %	384124344
492	NC_017157	ACG	2	6	23424	23429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124344
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496	NC_017157	TAAT	2	8	23563	23570	50 %	50 %	0 %	0 %	384124344
497	NC_017157	CCT	2	6	23580	23585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384124344
498	NC_017157	GA	3	6	23686	23691	50 %	0 %	50 %	0 %	384124344
499	NC_017157	CTC	2	6	23720	23725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384124344
500	NC_017157	CACG	2	8	23821	23828	25 %	0 %	25 %	50 %	384124344

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